溫泉出露處基巖多為巖漿巖，其花崗巖占57℅，火山巖占30℅，沉積巖占13℅，變質(zhì)巖地區(qū)很少出露溫泉。溫泉出露明顯呈方向性，一般多呈北西和北東條帶狀排列，宏觀上看顯然與地質(zhì)構(gòu)造有關(guān)。溫泉主要分布在福州---順昌北西構(gòu)造以南，較高溫度的溫泉又多分布在永定---閩清北東向構(gòu)造以東地區(qū)。溫泉與新構(gòu)造差異升降幅度、速度延續(xù)性密切相關(guān)。

 

  閩東南沿海地區(qū)，新構(gòu)造運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)為持續(xù)上升區(qū)，，上升時(shí)間長，幅度大，速度訣，平均每年以2.5mm速度上升，地表出露大面積深源混熔花崗巖。從其出露與形成深度考慮，其形成后至少上升3公里以上，故區(qū)內(nèi)溫泉出露多，溫度亦較高。但濱海平原與紅土臺(tái)地區(qū)例外，因平原第四系地層沉積厚度較大，屬局部下降區(qū)；紅土臺(tái)地雖然屬排列上升區(qū)，但上升速度較慢，地質(zhì)史上屬較穩(wěn)定地段，故溫泉甚少出露。九龍江河口處的廈門---漳州一帶屬新構(gòu)造運(yùn)動(dòng)強(qiáng)烈地區(qū)，其垂直形變平均每年在5mm左右，第四系同一地層界面在九龍江南北岸出露標(biāo)高相差可達(dá)100米以上，故該地區(qū)是福建省近代中度地震頻繁發(fā)生區(qū)，也是較高溫泉分布區(qū)。

 

  閩東北沿海地區(qū)，新構(gòu)造運(yùn)動(dòng)以下降為主，寧德以南微有上升，最大處可達(dá)3mm/年，地表火山巖廣布，花崗巖露頭少，上升量少，因此溫泉出露甚少。

 

  閩西北地區(qū)，該區(qū)屬大面積穩(wěn)定上升區(qū)，垂直形變水平梯度甚小，古老變質(zhì)巖廣泛出露而剝蝕，故少溫泉，更無較高溫度的溫泉出露。  閩西南地區(qū)，新構(gòu)造表現(xiàn)為差異上升區(qū)，垂直形變水平梯度較大，第四系地層厚度變化大(單厚10---90米)，溫泉出露較多。

 

  溫泉與環(huán)狀構(gòu)造有關(guān)，據(jù)衛(wèi)星照片分析，福建有很多以古火山口為中心的環(huán)狀構(gòu)造，較大的如永泰---福州、永定---詔安、永安環(huán)狀構(gòu)造。其周圍分布的溫泉約占全省溫泉數(shù)的二分之一。環(huán)狀構(gòu)造在垂直形變表現(xiàn)為上升區(qū)，可能與巖漿活動(dòng)有關(guān)。當(dāng)環(huán)狀構(gòu)造與北西向構(gòu)造、北東東向構(gòu)造復(fù)合往往成為較高溫度溫泉的分布區(qū)。